Японія — це розлогий архіпелаг у Тихому океані, що налічує понад 6 800 островів, серед яких виділяють чотири найбільші: Хонсю, Хоккайдо, Кюсю та Сікоку. Через значну протяжність з півночі на південь клімат країни змінюється від субарктичного з потужними снігопадами до вологого субтропічного. Близько 75% території займають гори та ліси, що зумовлює високу щільність населення на вузьких прибережних рівнинах. Такий ландшафт сформував особливе ставлення японців до землі як до обмеженого та надзвичайно цінного ресурсу.
Найвищою точкою та головним символом нації є гора Фудзі — діючий стратовулкан, що має майже ідеальну симетричну форму конуса. Розташована на острові Хонсю, Фудзі-сан вважається священним місцем, яке протягом століть надихало поетів та художників. Щороку тисячі людей здійснюють сходження на її вершину, щоб зустріти світанок, який у Японії називають «горайко». Гора є частиною національного парку Фудзі-Хаконе-Ідзу і внесена до списку Всесвітньої спадщини ЮНЕСКО.
Японія розташована в межах Тихоокеанського вогняного кільця, що робить її однією з найбільш сейсмічно активних зон у світі. На архіпелазі налічується понад 110 активних вулканів, а землетруси різної сили відбуваються майже щодня. Проте ця ж вулканічна активність подарувала країні тисячі термальних джерел — онсенів. Культура купання в гарячих мінеральних водах просто неба стала невід'ємною частиною японського способу життя та популярним методом оздоровлення й релаксації.
Однією з найбільш захопливих особливостей географії країни є чітко виражена зміна чотирьох пір року, кожна з яких має власну візуальну естетику. Навесні країна занурюється у рожеву піну цвітіння сакури, літо приносить сезон дощів та пишну зелень, осінь розфарбовує гори червоними барвами кленів момідзі, а зима вкриває північні префектури глибоким снігом. Це циклічне оновлення природи визначає календар фестивалів, кулінарні вподобання та навіть ритм ділового життя японців.